1、“林木比较功能基因组学”，国家杰出青年科学基金（2015.1-2019.12)，资助金额400万元，主持。
2、“杨树GST基因家族极端环境适应性进化机制研究”，国家自然科学基金重大研究计划/培育项目 (2013.1-2015.12)，资助金额100万元，主持。
3、“优质林木抗逆生长的功能基因组学”，科技部973项目二级课题 (2009.1-2014.12)，资助金额388万元，第二主持。
4、“植物GST基因家族的功能性进化”，国家自然科学基金面上项目(2007.1-2010.12)，资助金额30万元，主持。
5、“同倍性杂交物种形成和适应性进化的遗传基础”，国家自然科学基金重点项目 (2009.1-2012.12)，资助金额180万元，参加。
6、“植物谷胱甘肽转移酶基因家族序列与功能分化的进化生物学意义”，国家自然科学基金主任基金(2007.1-2007.12)，资助金额10万元，主持。
7、“亚热带森林生态系统中菌根真菌多样性研究”，国家自然科学基金主任基金 (2008.1-2008.12)，资助金额15万元，主持。
8. “植物小种群的生态遗传学效应与物种濒危机制研究” 中国科学院知识创新工程重要方向项目 (2007.1-2009.12)，主持子课题“植物与菌根真菌的互作与物种的适应与生存”，资助金额25万元。
9、在瑞典攻读博士学位期间，独立申请到Stiftelsen J C Kempes Minnes Stipendiefond (Sweden) 基金会项目:Detection and quantification of Wallemia sebi by real-time PCR in agriculture environments. 执行时间 2005 - 2006。资助金额：12,000.00 SEK。
