我国花卉产业及科学研究自20世纪80年代后期开始恢复发展，尤其1992年国家将花卉行业由农业部调整为由林业部作为行业管理部门，中国林科院于1996年设立院花卉研究开发中心，开始研究国外花卉研究及产业发展状况。目前花卉（园林植物与观赏园艺）已经成为改善城乡人居环境的重要内容，成为整个国家建设生态文明社会的重要组成部分。2006年，国家林业局正式批复中国林科院，同意依托中国林科院成立国家林业局花卉研究与开发中心，中国林科院同时下发文件取消院花卉研究与开发中心。中心技术依托林业研究所。
中心核心目标是为我国花卉产业的健康发展的科技支撑。从宏观上，继续选择典型地区开展全国花卉产业布局、规划及发展战略研究，为各地花卉发展提供具体的规划技术支撑，促进花卉建设事业的健康发展；从微观上，联合全国花卉教学科研部门力量，整合科研优势，按步骤集中优势力量有重点地开展我国特色观赏植物的种质资源保存利用、重点物种的遗传潜力研究与新品种创制，以及城市人居环境建设中观赏植物应用技术与功能等方面的技术研究，快速提升我国花卉研究水平。主要研究方向：⑴特色观赏植物种质资源保存利用研究；⑵分子生物学等高新技术辅助种质资源创新；⑶花卉标准化生产和栽培管理技术的研究；⑷观赏植物应用及其功能研究。
中心成立前后取得较大成绩：参与制定全国花卉产业发展战略，对全国花卉产业起到了一定的指导、规划作用；在传统特色名花牡丹、兰科植物上引领着中国资源利用及现代化培育技术的发展，取得了较丰硕的研究成果。研究成果示范推广效果显著，建立了梯队合理、实力雄厚的研究队伍，在国内外同行中产生良好影响。花卉产业跻身为国家林业局“十二五”的十大建设重点发展产业之一。
